空氣微生物采樣器能夠模擬人體呼吸道解剖結構和空氣動力學生理特征，利用慣性撞擊原理，將懸浮在空氣中的微生物顆粒按一定的等級收集起來，然后進行培養和微生物學分析。空氣微生物采樣器的選型一般要考慮空氣微生物采樣器的性能、取樣目的和空氣環境類型。
  (1)不同類型空氣微生物采樣器的性能差異較大，空氣微生物采樣器的采集效率存在佳范圍。空氣微生物采樣器在一般情況下對小顆粒的采集效率較高。但是表面空氣微生物采樣器、孢子采樣器、離心采樣器對小顆粒的采集效率較低。
  (2)應根據取樣目的選擇空氣微生物取樣器。例如，僅僅要求空氣中的細菌總數，或者要求空氣中各種活體微生物的測定，或者要求所有微生物微粒的測定，或者進一步了解空氣中攜帶微生物顆粒的粒度分布狀況。根據上述不同的取樣目的，確定了空氣微生物采樣器，該采樣器是在液體介質中、固態培養基上或濾膜上收集空氣微生物的。
  (3)空氣環境類型試驗結果表明，不同環境空氣類型、不同地點（有無污染源）、不同時間、季節、氣候條件等條件下，空氣微生物的種類和污染程度存在較大差異。空氣中的微生物顆粒大小不一，差異較大。細菌0.5~1.0μm，真菌3~100μm；多數真菌孢子粒徑為1~5μm，病毒為0.01~0.1μm。
  室內空氣中可吸菌顆粒數（CFU/m3）占空氣中可吸菌顆粒數的50%~90%。當空氣中微生物污染嚴重時，應考慮使用不易或不易超負荷的取樣器。